Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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