Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms