Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3DP05423 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms