Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3P05106 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms