Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF3O95398 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms