Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTNBO60941 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTNBO60941 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTNBO60941 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms