Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF10O60809 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF10O60809 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms