Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPNO60542 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPNO60542 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPNO60542 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms