Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms