Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms