Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms