Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRC1O43663 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRC1O43663 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms