Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms