Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L12C9JPN9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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