Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRDCB7Z8K6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms