Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DGG1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DGG1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DGG1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DGG1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DGG1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms