Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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LINC00587B1AMM8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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