Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HACD1B0YJ81 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms