Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms