Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms