Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS37CA5D8V6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms