Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC78A2IDD5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms