Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms