Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms