Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1DQ9Y2S0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms