Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM2AQ9Y2K7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms