Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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