Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH4Q9UQ05 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH4Q9UQ05 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms