Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms