Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms