Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms