Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSKSQ9UJT2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSKSQ9UJT2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms