Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms