Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPN3Q9UHW5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms