Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms