Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms