Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS29Q9UBQ0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms