Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms