Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms