Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD5Q9P267 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD5Q9P267 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms