Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC180Q9P1Z9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms