Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms