Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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