Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms