Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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