Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms