Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KRT82Q9NSB4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT82Q9NSB4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms