Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms