Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms