Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms